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杨志团队开发多模态MRI脑影像数据处理流水线新软件——PhiPipeKaiyun 开云

发布时间：2023-01-14 10:23:13 丨 浏览次数：918

　　PhiPipe回应了以上两个重要需求。PhiPipe能够同时处理T1-3D，静息态或任务态fMRI和DWI，并提取13个常用的刻画脑结构和功能的脑影像指标。由于优化了处理流程和多模态影像之间的配准方法，PhiPipe使多模态影像数据的融合更加简便和高效。

　　我们采用7个大规模公开数据集对PhiPipe提取的神经影像指标的重测信度和预测效度进行了系统性的评估。信效度的评估有助于实验设计和统计分析 (比如，估计样本量)。通过与DPARSF/PANDA（常用的单模态流水线软件）进行比较发现，PhiPipe在大多数脑影像指标上和DPARSF/PANDA具开云体育 开云官网有相当的信效度，在少数脑影像指标上比DPARSF/PANDA具有更高的信效度。开云体育 kaiyun.com 官网入口开云体育 kaiyun.com 官网入口

　　PhiPipe提取的各影像学指标的重测信度和年龄预测效度作为数据库分享：()，以便使用者查询。同时，该研究的学术贡献也包括首次建立了一个对流水线软件进行验证评估的方法学框架。

　　PhiPipe也具有设置简单、操作简洁、易于并行计算等特点。目前该系统已部署于上海市精神卫生中心神经影像平台INCloud，并已应用于超过10000例神经影像的处理。PhiPipe的源代码共享于：。

　　本研究于近日发表于Human Brain Mapping。上海交通大学医学院附属精神卫生中心的胡杨为第一作者，开云体育 kaiyun.com 官网入口杨志研究员为通讯作者，李青峰、乔凯妮、张骁晨和杭州师范大学陈兵博士也对此项工作做出了重要贡献。该项研究得到得到了国家自然科学基金、上海市科学技术委员会、上海市儿童健康服务能力建设项目、上海市精神卫生中心临床研究项目、上海市自开云体育 开云官网然科学基金、上海市教委、上海市科学技术委员会、上海市卫健委、上海市精神卫生临床研究中心和上海市精神卫生中心科研基金项目的支开云体育 开云官网持。